Каждый раз, когда нам врач выписывает, и мы пьем линекс, биофлор и т.д. у ребенка начинается запор и потом где-то неделю мне приходится делать ему клизмы.

Есть такой эффект у пробиотиков. Их назначают не только для восстановления бактериальной флоры, но при диарее, как заместительную терапию. Когда патогенные бактерии заменяются полезной микрофлорой.
Это реакция нормы, но для ребенка плохо, что не опорожняется кишечник. Вы введите в рацион свеклу, яблоки, кефир свежий, чтобы был слабительный эффект за счет продуктов, а не клизмы.
Можно параллельно давать препараты с лактулозой. Это и среда для бактерий, и натуральное слабительное.