Muslim 1981, на основании чего Вы сделали вывод, что у ребенка стоматит? Высыпания в ротовой полости не обязательно указывают на стоматит. Тем более Вы описываете симптомы ОРВИ: кашель и температура, общее беспокойство, плохой сон. Опять же высыпания во рту и температура могут быть следствием инфекционного заболевания, но сложно сказать какого именно, потому что детских инфекций много.
Вам лучше всего сходить на прием не к стоматологу, к в детскому инфекционисту. Они постоянно сталкиваются с заболеваниями, чаще чем педиатры, и точно диагностируют болезнь.